2016. aastal algas Heino Elleri Muusikakoolis mentor-programm Elleri Akadeemia, mille raames käivad Elleri koolis regulaarselt õpetamas Euroopas stažeerivad ja omal alal tuntud professionaalid. Muusikud külastavad Elleri kooli 2-4 korda õppeaastas, annavad tunde põhiliselt Elleri kooli õpilastele, kuid ka teistele. Seni on Elleri Akadeemia õppejõududeks olnud Heili Rosin (flööt), Guntis Kuzma (klarnet), Tatiana Chernichka (klaver), Indrek Leivategija (tšello), Rūta Lipinaitytė (viiul), Miloš Petrović (viiul), Wolfgang Rings (vioola), Nicolas Prost (saksofon), Jaak Sikk (improvisatsioon), Sergio Castrillon (improvisatsioon) ja Patricio Zeoli (kitarr), Jueyoung Yang (viiul), Minkyung Sul (viiul), Paulina Riquelme (vioola).

​